近年來食品摻假問題屢見不鮮，而且摻假問題已成為全球問題。伴隨著科技快速發展的同時，食品摻假水平和手段也越來越高明，仿真度極高的劣質產品給檢驗工作帶來了巨大困難，使許多檢測鑒別摻偽的傳統方法失效。食品造假手段不斷翻新，鑒別方法也在不斷發展，如何運用新型高科技檢測手段讓摻假無機可趁已成為食品行業的重中之重。
同位素技術目前是國際上用于辨別食品真假、追溯食品來源和實施產地保護的一種有效方法，在食品安全領域的應用前景廣闊。
穩定同位素技術的出現加深了生態學家對生態系統的進一步了解，使生態學家可以探討一些其它方法無法研究的問題。與其它技術相比，穩定同位素技術的優點在于其能使這些生態和環境科學問題的研究定量化，并且是在沒有干擾(如沒有放射性同位素的環境危害)的情況下進行。
有些問題還只能通過利用
穩定同位素技術來解決，現在有許多農業研究機構和大學已經開始使用高精度同位素質譜計從事合理用肥、果實營養、固氮分析、農藥毒性、家畜氣候對作物的影響的研究，以及食品質量控制等多方面的研究工作。
與原子能和地質研究工作相比，在農業和食品方面應用同位素方法從事科研和檢測工作正處于方興未艾的階段，隨著人類社會的發展，對農業的要求也越來越高，今后大力開展和普及運用現代化方法研究農業增產、改善果實質量以及進行食品質量控制檢測的工作前途無限廣闊。
由于穩定同位素在分子質量上的差異，所有在自然界或者人工加工過程中會產生同位素分餾現象。
例如：蒸發過程中的同位素分餾，H2O16比H2O18運動得更快，更容易擴散到水汽中，故隨著蒸發的進行，剩下的水中H2O18越來越多。同理，H2O16比HDO16運動得更快，隨著蒸發的進行，剩下的水中HDO16越來越多。
再例如：全球大氣CO2δ13C≈-6.4‰，但由于植物光合作用吸收利用CO2時歧視（排斥）13CO2（即同位素分餾），故植物體的δ13C要小于-6.4‰，且C3植被和C4植被對13CO2的歧視程度不一樣，C3植被更歧視13CO2（即C3植被對13CO2分餾作用更強），導致C3植被的δ13C小于C4植被的δ13C。（注，根據上述公式的定義可以得知，
13C含量越少，δ13C越小）
一方水土養育一方人，同樣，來自不同區域的動植物樣品因各地環境因素（如氣候，土壤類型，水文條件等）的差異，其樣品中的各穩定同位素的比值亦有差異。每一種同位素提供某些關于環境的信息，這就是關于它的來源的環境指紋，這些“同位素指紋"信息將告訴我們“樣品來自何處”和“樣品是如何生產”的（原產地和生產方式）。
基于上述原理，穩定同位素廣泛領用與食品溯源，食品摻雜等領域。所謂食品溯源就是根據食品攜帶的同位素指紋信息，在沒有背景資料的情況下，確定出食品的產地信息。食品產品是根據食品本周的同位素信息確定其真實性。
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